• Các yêu cầu xử lý hữu cơ (theo điều 7 CFR § 205.270) cho phép sử dụng các chất phi nông nghiệp được liệt kê tại điều § 205.605 chẳng hạn như nấm men để sử dụng trong hoặc trên sản phẩm nông nghiệp đã qua chế biến được coi là “hữu cơ” nếu sản phẩm nông nghiệp đó chứa ít nhất 95% nguyên liệu là sản phẩm nông nghiệp hoặc sản phẩm nông nghiệp đã qua chế biến. 5% còn lại có thể là chất phi nông nghiệp như những chất được liệt kê tại điều § 205.605; điều này bao gồm nấm men. Do đó, ví dụ: nếu nấm men được thêm vào một sản phẩm nông nghiệp hữu cơ đã được chứng nhận như bột mì và được xử lý tuân theo quy định tại điều § 205.270 thì sản phẩm tạo ra có thể được chứng nhận và dán nhãn “hữu cơ”.
• Việc chứng nhận các sản phẩm nông nghiệp đã qua chế biến được liệt kê là phi nông nghiệp theo điều § 205.605(a) không phải là không có tiền lệ. Ví dụ, NOP trước đây đã xác định rằng hương vị tự nhiên, mặc dù chúng được liệt kê là sản phẩm phi nông nghiệp được phép trong sản xuất hữu cơ, nhưng có thể được chứng nhận hữu cơ nếu được xử lý tuân thủ các quy định của NOP. Tình trạng của nấm men được các nhà chăn nuôi đặc biệt quan tâm, những người nuôi nấm men cho vật nuôi như một chất bổ sung thức ăn phi nông nghiệp, phi tổng hợp. Nấm men có sẵn để sử dụng trong thức ăn chăn nuôi ở dạng hữu cơ được chứng nhận hoặc dưới dạng đầu vào phi hữu cơ được phép quy định trong Danh sách Quốc gia (National List).
• Một hoạt động hữu cơ được chứng nhận có thể bán, dán nhãn hoặc mô tả là “ hữu cơ” khi được sản xuất tuân thủ kế hoạch hệ thống hữu cơ đã được phê duyệt. Các sản phẩm nấm men được sản xuất từ nguyên liệu hữu cơ đầu vào như bột, rượu ngâm từ ngô hữu cơ có thể được chứng nhận là hữu cơ. Để nấm men được chứng nhận là hữu cơ, nấm men sử dụng làm nguyên vật liệu ban đầu thì không cần phải được chứng nhận. Tuy nhiên, nếu sử dụng nấm men hữu cơ làm nguyên vật liệu ban đầu thì sản phẩm sau đó đủ điều kiện để được chứng nhận là “100% organic” miễn là đáp ứng được tất cả các yêu cầu sản xuất và xử lý theo quy trình hữu cơ.
• Các trang trại chăn nuôi động vật được chứng nhận “hữu cơ” có thể cho vật nuôi của họ ăn nấm men phi hữu cơ dưới dạng chất bổ sung thức ăn không tổng hợp được quy định tại điều § 205.237(a)